Harvesting Context and Mining Emotions Related to Olfactory Cultural Heritage

UIDB/00657/2020 UIDP/00657/2020This paper presents an Artificial Intelligence approach to mining context and emotions related to olfactory cultural heritage narratives, particularly to fairy tales. We provide an overview of the role of smell and emotions in literature, as well as highlight the importance of olfactory experience and emotions from psychology and linguistic perspectives. We introduce a methodology for extracting smells and emotions from text, as well as demonstrate the context-based visualizations related to smells and emotions implemented in a novel smell tracker tool. The evaluation is performed using a collection of fairy tales from Grimm and Andersen. We find out that fairy tales often connect smell with the emotional charge of situations. The experimental results show that we can detect smells and emotions in fairy tales with an F1 score of 91.62 and 79.2, respectively.publishersversionpublishe

Apoio emocional às crianças profissionais de saúde: intervenção virtual durante a pandemia de COVID-19.

The SARS-CoV2 pandemic context and sanitary confinement measures have exposed the population to anxiety and depressive symptoms and became a permanent mark in children’s psychosocial and affective development. This effect was certainly evident in healthcare professional’s children that saw their parents being called to the battlefield front line against an invisible enemy and at the same time facing the media avalanche propelling fear and insecurity. Material and Methods: This state of restlessness and vulnerability promoted the development of therapeutic mindfulness groups for children or children and parents (healthcare professional related), from a Hospital Reference Center, over a period of eight weeks. Results: Throughout the sessions, high adherence to conscious attention techniques was observed, allowing the children to overcome physical distance obstacles in a virtual context used as a gateway to the living circumstances and the difficulties experienced at the time of the intervention. Discussion: In the end, improvements were reported in anxious and depressive symptoms with greater capacity for emotional regulation, interpersonal communication and impulse management. Conclusion: These results instigated an intervention protocol elaboration and a research project ongoing at the date of this publication.El contexto pandémico del SARS-CoV2 y las medidas de confinamiento sanitario han expuesto a la población a síntomas de ansiedad y depresión y se han convertido en una marca permanente en el desarrollo psicosocial y afectivo de los niños. Este efecto fue ciertamente evidente en los hijos de los profesionales de la salud que vieron a sus padres ser llamados al frente del campo de batalla contra un enemigo invisible y al mismo tiempo enfrentarse a la avalancha mediática que impulsaba el miedo y la inseguridad. Material y Métodos: Este estado de inquietud y vulnerabilidad propició el desarrollo de grupos de mindfulness terapéuticos para niños o niños y padres (relacionados con el profesional de la salud), desde un Centro de Referencia Hospitalario, durante un período de ocho semanas. Resultados: A lo largo de las sesiones se observó una alta adherencia a las técnicas de atención consciente, lo que permitió a los niños superar los obstáculos de la distancia física en un contexto virtual utilizado como puerta de entrada a las circunstancias de la vida y las dificultades vividas en el momento de la intervención. Discusión: Al final, se reportaron mejoras en los síntomas ansiosos y depresivos con mayor capacidad de regulación emocional, comunicación interpersonal y manejo de impulsos. Conclusión: Estos resultados impulsaron la elaboración de un protocolo de intervención y un proyecto de investigación en curso a la fecha de esta publicación.Introdução: O contexto pandémico SARS-CoV2 e as medidas de confinamento tornaram a população vulnerável a sintomas ansiosos e depressivos e são um marco indelével no desenvolvimento psicossocial e afetivo das crianças. Tal foi notório nos filhos de profissionais de saúde, que perante a avalanche mediática propulsora de medo e insegurança, viram os seus progenitores ser chamados para a linha da frente de um campo de batalha contra um inimigo invisível. Material e Métodos: Este estado de inquietação e vulnerabilidade promoveu a elaboração de grupos terapêutico baseados no mindfulness para grupos de crianças (filhas de profissionais de saúde) de um Centro Hospitalar de referência, durante um período de oito semanas. Resultados: Participaram um total de quinze crianças e uma adolescente, sendo as crianças divididas em três grupos (dois grupos multifamiliares e um com crianças com idades entre oito e onze anos) e mantendo-se a adolescente em sessões individuais. Apenas uma criança não concluiu as oito sessões da terapia. Objetivou-se uma elevada adesão às técnicas de atenção plena e consciente, tendo sido transpostas as dificuldades impostas pelo distanciamento físico. A plataforma virtual foi usada como uma porta de acesso ao contexto vivencial e às dificuldades experienciadas no momento da intervenção. Discussão: No final foram reportadas melhorias na sintomatologia ansiosa e depressiva, com maior capacidade de regulação emocional, de comunicação interpessoal e gestão dos impulsos. Conclusão: Estes resultados promoveram a elaboração de um protocolo de intervenção e a realização de um projeto de investigação, em curso à data desta publicação

SARS-CoV-2 introductions and early dynamics of the epidemic in Portugal

Genomic surveillance of SARS-CoV-2 in Portugal was rapidly implemented by the National Institute of Health in the early stages of the COVID-19 epidemic, in collaboration with more than 50 laboratories distributed nationwide. Methods By applying recent phylodynamic models that allow integration of individual-based travel history, we reconstructed and characterized the spatio-temporal dynamics of SARSCoV-2 introductions and early dissemination in Portugal. Results We detected at least 277 independent SARS-CoV-2 introductions, mostly from European countries (namely the United Kingdom, Spain, France, Italy, and Switzerland), which were consistent with the countries with the highest connectivity with Portugal. Although most introductions were estimated to have occurred during early March 2020, it is likely that SARS-CoV-2 was silently circulating in Portugal throughout February, before the first cases were confirmed. Conclusions Here we conclude that the earlier implementation of measures could have minimized the number of introductions and subsequent virus expansion in Portugal. This study lays the foundation for genomic epidemiology of SARS-CoV-2 in Portugal, and highlights the need for systematic and geographically-representative genomic surveillance.We gratefully acknowledge to Sara Hill and Nuno Faria (University of Oxford) and Joshua Quick and Nick Loman (University of Birmingham) for kindly providing us with the initial sets of Artic Network primers for NGS; Rafael Mamede (MRamirez team, IMM, Lisbon) for developing and sharing a bioinformatics script for sequence curation (https://github.com/rfm-targa/BioinfUtils); Philippe Lemey (KU Leuven) for providing guidance on the implementation of the phylodynamic models; Joshua L. Cherry (National Center for Biotechnology Information, National Library of Medicine, National Institutes of Health) for providing guidance with the subsampling strategies; and all authors, originating and submitting laboratories who have contributed genome data on GISAID (https://www.gisaid.org/) on which part of this research is based. The opinions expressed in this article are those of the authors and do not reflect the view of the National Institutes of Health, the Department of Health and Human Services, or the United States government. This study is co-funded by Fundação para a Ciência e Tecnologia and Agência de Investigação Clínica e Inovação Biomédica (234_596874175) on behalf of the Research 4 COVID-19 call. Some infrastructural resources used in this study come from the GenomePT project (POCI-01-0145-FEDER-022184), supported by COMPETE 2020 - Operational Programme for Competitiveness and Internationalisation (POCI), Lisboa Portugal Regional Operational Programme (Lisboa2020), Algarve Portugal Regional Operational Programme (CRESC Algarve2020), under the PORTUGAL 2020 Partnership Agreement, through the European Regional Development Fund (ERDF), and by Fundação para a Ciência e a Tecnologia (FCT).info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Minimal information for studies of extracellular vesicles 2018 (MISEV2018):a position statement of the International Society for Extracellular Vesicles and update of the MISEV2014 guidelines

The last decade has seen a sharp increase in the number of scientific publications describing physiological and pathological functions of extracellular vesicles (EVs), a collective term covering various subtypes of cell-released, membranous structures, called exosomes, microvesicles, microparticles, ectosomes, oncosomes, apoptotic bodies, and many other names. However, specific issues arise when working with these entities, whose size and amount often make them difficult to obtain as relatively pure preparations, and to characterize properly. The International Society for Extracellular Vesicles (ISEV) proposed Minimal Information for Studies of Extracellular Vesicles (“MISEV”) guidelines for the field in 2014. We now update these “MISEV2014” guidelines based on evolution of the collective knowledge in the last four years. An important point to consider is that ascribing a specific function to EVs in general, or to subtypes of EVs, requires reporting of specific information beyond mere description of function in a crude, potentially contaminated, and heterogeneous preparation. For example, claims that exosomes are endowed with exquisite and specific activities remain difficult to support experimentally, given our still limited knowledge of their specific molecular machineries of biogenesis and release, as compared with other biophysically similar EVs. The MISEV2018 guidelines include tables and outlines of suggested protocols and steps to follow to document specific EV-associated functional activities. Finally, a checklist is provided with summaries of key points

Sexual plots in Charles Darwin and George Eliot : evolution and manliness in Adam Bede and The mill on the floss

This thesis explores the intersections between George Eliot's and Charles Darwin's fictional and scientific styles whilst demonstrating that Eliot and Darwin are both novelistic scientists and scientific novelists. By analysing their representation of masculinity, in particular masculine subjectivity, I argue that literature and science are first and foremost modes of expression, based on internal perceptions and projections, themselves variable, and liable to external influences. It is precisely the extent of these influences that determines the degree of feminine and masculine performativity. Close readings of Eliot's and Darwin's works ultimately reveal a complex and controversial communication, whilst uncovering two authors self-consciously aware of the importance of style, form, and the staging of visual representations.EThOS - Electronic Theses Online ServiceGBUnited Kingdo

Genetic variation in two littorinid gastropods along the East African coast: comparison with morphological data

Tese de mestrado. Biologia (Biologia Evolutiva e do Desenvolvimento). Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2011Um dos principais focos da Biologia Evolutiva é compreender a origem e os processos pelos quais as populações de organismos divergem e se tornam distintas. A diversidade a nível intra-específico pode afectar os processos ecossistémicos, existindo evidências empíricas de que a estabilidade dos ecossistemas pode ser aumentada se existir uma elevada diversidade genética ou fenotípica das espécies. Como tal, a diversidade genética nas populações é importante, não apenas para o potencial evolutivo de uma espécie a longo prazo, mas também para a existência de flexibilidade face a alterações ambientais que afectam os processos ecológicos. Esta possibilidade tem implicações importantes em termos conservacionistas e merece um estudo mais aprofundado, sendo importante ter em conta que a análise da diversidade e diferenciação genética das populações irá providenciar informação fundamental para a conservação, permitindo a preservação da biodiversidade e uma melhor gestão dos recursos vivos. Nos ambientes marinhos, a estrutura genética populacional é influenciada pelos requisitos ecológicos específicos e pelo padrão de história vital dos organismos. Assim sendo, a diferenciação genética em organismos marinhos é altamente influenciada pela sua capacidade de dispersão e, consequentemente, pelo seu modo de reprodução. Para a maioria dos invertebrados marinhos, a chave para a compreensão da estrutura populacional, baseia-se, em parte, no conhecimento da sua dispersão, que, em geral, é muito limitada quando adultos. Dessa forma, a presença ou ausência de uma fase larvar planctónica tem-se mostrado um factor importante na determinação do grau de estruturação espacial das populações nestes organismos. A dispersão de estados larvares permite a troca de indivíduos e genes ao longo da extensão geográfica natural das populações, que pode ser contínua se não houver restrições à dispersão. Uma população distribuída continuamente pode aproximar-se da panmixia, ou pode ser caracterizada por um isolamento por distância, onde a troca de indivíduos e genes ocorre localmente. No entanto, pouco se sabe sobre a prevalência de isolamento por distância em diferentes espécies marinhas, e de que forma é que a variação no fluxo genético e distâncias de dispersão podem afectar a sua expressão a diferentes escalas geográficas. É necessário também ter em conta que factores ambientais podem influenciar a presença ou ausência de estruturação nas populações marinhas. Por exemplo, os padrões de circulação de massas de água, os regimes de temperatura e a topografia costeira afectam grandemente a estrutura populacional em ambientes costeiros, e podem oferecer muitas oportunidades de dispersão passiva. Os eventos de afloramento costeiro, regime de marés, e fluxo estuarino também podem influenciar a dispersão, a uma menor escala espacial. No entanto, muitos destes factores ambientais podem ter um efeito duplo: podem ser responsáveis pela dispersão de larvas planctónicas, actuando como corredores ao fluxo genético ou, alternativamente, podem funcionar como barreiras físicas ao fluxo genético. Assim, um elevado potencial de dispersão nem sempre se traduz em elevados níveis de fluxo genético, e as espécies podem não atingir o seu potencial de dispersão devido a mecanismos de retenção local. Pensa-se, actualmente, que é possível que o nível de estruturação genética se reflicta em diferenças a nível fenotípico. No entanto, a contribuição relativa de factores genéticos e ambientais para a expressão fenotípica não foi ainda resolvida. O mesmo se verifica em relação a factores físicos e biológicos que se pensa promoverem a diferenciação morfológica entre populações contíguas, e que são ainda pouco compreendidos. As espécies exibem, muito frequentemente, variações espaciais e temporais nas suas características morfológicas, e, uma vez que têm sido detectadas grandes diferenças entre populações que habitam locais e ambientes diferentes, a determinação das bases para a diferenciação fenotípica é fundamental para a compreensão da evolução dos organismos. Neste sentido, neste estudo recorreu-se ao uso de dados genéticos e morfológicos, que permitem fazer a interpretação de padrões de variabilidade, permitindo investigar-se a fonte duma possível variação inter-populacional e, também, reconhecer (ou não) a existência de grupos discretos de indivíduos ao longo de áreas costeiras. Mais especificamente, pretendeu-se inferir sobre o fluxo genético na espécie Cerithidea decollata, nos mangais costeiros do Leste Africano, à luz dos padrões putativos de transporte pelas correntes marinhas. A análise separada destes dois tipos de dados irá ajudar a estabelecer até que ponto é que os factores ambientais influenciam a expressão de variabilidade fenotípica em C. decollata, assim como melhorar a compreensão da biogeografia da espécie. O foco da investigação resume-se na avaliação dos padrões filogeográficos da espécie através da análise de marcadores genéticos (sequências parciais do gene mitocondrial da citocromo oxidase I - COI) e de informação quantitativa morfométrica da concha, revelando os níveis de diversidade populacional. O estudo foi realizado ao longo de um gradiente geográfico latitudinal: toda a costa leste Africana (desde o Quénia à República da África do Sul). A informação sobre a estrutura das populações destes gastrópodes dos mangais irá contribuir para um progresso na área da biologia evolutiva, uma vez que os factores mais importantes na formação das estruturas filogeográficas actuais deste género são ainda pouco conhecidos. Esta tese é constituída por 3 partes distintas: uma introdução geral (capítulo 1), uma investigação específica (capítulo 2) e as conclusões finais (capítulo 3). O trabalho científico desenvolvido resultou num artigo científico, a submeter numa revista internacional indexada. No capítulo 2, averiguou-se as diferenças na forma da concha dos espécimes das 32 localidades amostradas através de técnicas de morfometria geométrica, recorrendo a análise de imagem e análises estatísticas. Os resultados indicam que existe uma convergência na forma da concha, e que os diversos morfotipos se sobrepõem ao longo do gradiente em estudo. No entanto foi revelada uma variação significativa entre localidades, indicando que, para a espécie em causa, existe maior variabilidade morfológica a mesoescalas espaciais do que a macroescalas espaciais. Este padrão é provavelmente uma consequência da similaridade de condições ambientais a que os indivíduos estão expostos ao longo do gradiente, levando a uma convergência de formas entre as diversas regiões geográficas – a uma macroescala geográfica (norte, centro e sul do gradiente), mas a acção de factores mais locais pode levar a alguma diferenciação entre localidades. Relativamente à análise genética, utilizaram-se sequências parciais do gene COI, sequenciadas a partir de 172 indivíduos distribuídos por 30 populações ao longo da costa. Uma primeira análise exploratória revelou elevada variação nas diversidades haplotípica e nucleotídica consoante a população. A rede de haplótipos revelou a existência de relações complexas entre haplótipos, resultando numa estruturação genética populacional moderada ao longo da costa, o que foi confirmado pelas análises de variância molecular (AMOVAs). Investigou-se também a história demográfica dos grupos filogeográficos definidos, através de testes de neutralidade e análises da distribuição das frequências das diferenças genéticas encontradas. Os resultados foram consistentes com a hipótese de expansão demográfica recente a norte do gradiente (Quénia, Tanzânia, Moçambique norte), o que tem sido verificado também para outras espécies do oceano Índico. Para as zonas centro (Moçambique centro) e sul do gradiente (Moçambique sul e Républica da África do Sul), os resultados sugerem vários eventos de colonização. Verificou-se ainda a existência de uma correlação significativa entre distâncias genéticas e geográficas. Visto que se prevê uma elevada capacidade de dispersão para esta espécie, por possuir estados larvares planctónicos de 2-3 semanas, estes resultados indicam a possibilidade de um isolamento por distância devido a barreiras físicas, havendo um factor de interacção entre a hidrologia costeira e a conectividade das populações. Combinando os resultados provenientes da análise de morfometria geométrica e da análise genética, observa-se que estes apontam para a existência de uma certa independência entre a variabilidade genética e morfológica observadas. Na realidade, as diferenças genéticas obtidas não se traduziram em diferenças significativas na forma da concha, sendo que a variação desta última se pode dever à existência de plasticidade na expressão de fenótipos, ainda que isso não seja possível de demonstrar recorrendo apenas ao dados deste estudo. A combinação de métodos morfométricos com a genética molecular mostrou ser uma ferramenta robusta para analisar a diferenciação das populações em diversos aspectos, permitindo aumentar o conhecimento sobre diferenciação populacional desta espécie marinha, que poderá eventualmente fornecer uma base para o desenvolvimento de outros estudos relacionados. Foram evidenciados os possíveis factores que levam à divergência genética e morfológica das populações, numa escala espacial muito abrangente, fornecendo informação sobre os padrões de diversidade na costa Leste Africana. Por fim, recomenda-se que este estudo, e outros estudos do mesmo tipo, possam ser aprofundados através de análises complementares que permitam estudar os níveis de diferenciação ecológica e adaptativa entre populações, para que se possa compreender melhor a influência de factores ambientais na evolução das espécies.In this study I aimed to investigate the sources of a possible inter and intra population variation and the existence of discrete groups of individuals in the mangrove gastropod Cerithidea decollata along the eastern coast of Africa. The combined analysis of morphometric and genetic data helped to improve the comprehension of the population genetic structure and phylogeography of the species. The assessment of shell shape variation revealed a convergence of morphological characteristics with an overlap of shape across the latitudinal gradient in study. However, significant differences were found among sampling localities, showing that most variation in shape occurs at meso spatial scales but not at macro spatial scales. This pattern is most likely a consequence of the similarity of environmental conditions to which specimens are exposed along the coast, leading to a convergence of shell shape across the gradient. Nevertheless the action of specific local pressures may lead to some shape variation among locals. Regarding the genetic analysis, I used partial sequences of the mitochondrial gene cytochrome oxidase I (COI) sequenced from 172 individuals distributed by the populations along the coast. The network analysis showed the existence of a moderate population genetic differentiation along the coast, which was confirmed by the molecular variance analyses. The demographic history of the defined groups was also investigated using neutrality tests and mismatch distributions. The results were consistent with the sudden expansion hypothesis for the northern region of the gradient, which has also been observed for other species inhabiting in the Indian Ocean. A correlation between genetic and geographic distances was also observed. Once it was predicted a high dispersal ability for C. decollata, due to its planktonic larval stage of 2-3 weeks, these results indicate the possibility of isolation by distance as consequence of physical barriers with the existence of a correlation between coastal hydrology and population connectivity. The predominant mechanisms that lead to population differentiation include a combination of factors, such as dispersal ability of the species, ocean currents, habitat discontinuities, phenotypic plasticity, physical barriers and geographical distance. The information about the population structure of this mangrove gastropod will contribute to a progress in evolutionary biology, once the determinant factors in the formation of the actual phylogeographic structures of this kind still remain unsettled

Os enfermeiros na promoção de esperança nos pais de crianças com doença crónica

Introdução: Em Pediatria, a esperança pode ser considerada como um fator protetor dos profissionais de saúde e da criança/família. Objetivo: Analisar a influência da perceção de esperança de profissionais de saúde, no cuidar da criança com doença crónica e família. Métodos: estudo transversal e descritivo, realizado numa amostra de 102 profissionais de saúde da região centro de Portugal. Eram mulheres 92,2%, com média de idade de 39,9 anos. Utilizou-se um questionário de caracterização sociodemográfica e profissional e a Escala de Esperança (Ribeiro, Pedro, & Marques, 2006). Resultados: Dos profissionais, 62,7% enfermeiros, 36,3% exerciam funções no serviço de pediatria há mais de 10 anos. Os psicólogos e assistentes sociais e os do género masculino revelaram maior perceção de esperança, mas apenas a idade se relacionou significativamente com a esperança global. Conclusão: A vivência de esperança sustenta a aliança terapêutica com a criança/família e o enfrentamento face à doença de um filho.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

O choque tecno-liberal, os media e o jornalismo: estudos críticos sobre a realidade Portuguesa

info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Harvesting Context and Mining Emotions Related to Olfactory Cultural Heritage

This paper presents an Artificial Intelligence approach to mining context and emotions related to olfactory cultural heritage narratives, particularly to fairy tales. We provide an overview of the role of smell and emotions in literature, as well as highlight the importance of olfactory experience and emotions from psychology and linguistic perspectives. We introduce a methodology for extracting smells and emotions from text, as well as demonstrate the context-based visualizations related to smells and emotions implemented in a novel smell tracker tool. The evaluation is performed using a collection of fairy tales from Grimm and Andersen. We find out that fairy tales often connect smell with the emotional charge of situations. The experimental results show that we can detect smells and emotions in fairy tales with an F1 score of 91.62 and 79.2, respectively

Avaliação do consumo de compostos bioativos no período da pandemia de Covid-19 – uma reflexão

A pandemia da Covid-19 trouxe a comunidade para uma reflexão quanto alimentação e nutrição. Micronutrientes e demais compostos bioativos são essenciais para o bom funcionamento do sistema imunológico. Foi aplicado questionário online visando conhecer o consumo de fontes de micronutrientes e compostos bioativos (alimentos e suplementos). Foi verificado aumento de consumo de frutas e ainda de suplementos. Estratégias de educação nutricional são fundamentais para que o indivíduo possa ter real consciência na autoindicação de suplementos. Lives temáticas vinculadas ao propósito deste estudo foram realizadas nos canais do LabBio/PPGAN utilizando as ferramentas Instagram e Youtube. Ampliar ações educativas à diversidade de indivíduos via web é uma forma de promover uma mudança no padrão de consumo de uma população